Pulau Jawa Wilayah III meliputi Provinsi Yogyakarta, dan Provinsi Jawa Tengah. Yang mana juga terdiri dari 4 wilayah sungai. Adapun daerah aliran sungai untuk masing-masing wilayah sungai sebagai berikut.
Wilayah Sungai Pemali Comal
Wilayah Sungai Bodri Kuto
Wilayah Sungai Serayu Bogowonto
Wilayah Sungai Progo Opak Serang
Hasil model peringatan dini banjir berupa peta spasial hujan serta tabel status peringatan dini.
Peta spasial hujan menampilkan distribusi curah hujan berbasis data satelit dari waktu simulasi hingga enam jam sebelumnya. Informasi ini digunakan untuk menganalisis pola dan intensitas hujan yang memengaruhi hasil simulasi FEWS serta potensi terjadinya banjir.
Tabel di bawah ini menyajikan rekapitulasi prediksi status peringatan dini banjir yang dihasilkan dari simulasi hidrologi FEWS. Penentuan status peringatan dilakukan berdasarkan hidrograf aliran yang terbentuk sebagai respons terhadap masukan hujan pada setiap sub-DAS.